Populační genomika odhaluje životní strategie prokaryot
Přednáší:
Lukáš Falteisek
V některých prostředích žijí tak jednoduché komunity prokaryot, že dokážeme nejen sekvenovat kompletní genomy dominantních druhů bez jejich izolace či binningu, ale můžeme v nich též sledovat vnitropopulační variabilitu. Takto lze odhalit nepravidelnosti genového roku, které dávají naději, že se konečně podaří objasnit, jakým mechanismem je tento proces regulován. Populační data též ukazují novou roli transpozonů v dlouhodobé regulaci genové exprese a rozrůznění životních strategií jinak identických bakterií. Jako bonus naše rozsáhlá studie jednoduchých mikrobiálních komunit z opuštěných dolů ukázala zajímavé vztahy mezi typem primární produkce a alfa i beta diverzitou prokaryot.